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Progetti
Epidemiologia genomica di Klebsiella pneumoniae

Questo progetto ha l’obiettivo di sequenziare i genomi di oltre cento ceppi del batterio patogeno K. pneumoniae e di analizzare le sequenze ottenute con tecniche bioinformatiche specifiche. SarÓ possibile valutare la presenza di fattori di virulenza e di fattori genici di resistenza agli antibiotici. Questi fattori/geni potranno essere confrontati con quelli giÓ pubblicati, valutando la loro attivitÓ grazie alla caratterizzazione fenotipica effettuata prima del sequenziamento.

Utilizzando analisi di tipo filogenomico e di SNP (Single Nucleotide Polymorphysms), sarÓ possibile ricostruire l’evoluzione di K. pneumoniae, determinare la variabilitÓ spaziale dei ceppi del patogeno, ed elaborare una solida base di conoscenza per ricostruire l’origine dei focolai epidemici dell’infezione (anche grazie al coinvolgimento di diverse strutture ospedaliere).

Tre genomi di K. pneumoniae sono giÓ stati pubblicati nell'ambito di questo progetto.

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