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Cos'è l'epidemiologia genomica
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Network Global Microbial Identifier
3 Novembre 2014, il progetto Epidemiologia Genomica pubblica un articolo sulla rivista "Antimicrobial Agents and Chemotherapy".
L'articolo costituisce il primo lavoro di epidemiologia genomica in Italia e il più ampio mai eseguito su Klebsiella pneumoniae. 89 genomi italiani sono stati sequenziati e l'intero lavoro è stato condotto su tutti i 319 genomi di K. pneumoniae disponibili nelle banche dati. Questo lavoro ha reso possibile la ricostruzione genomica e temporale dell'evoluzione del complesso clonale 258, ceppo in cui la resistenza ai carbapenemici è maggiormente presente.
Il lavoro ha, inoltre, permesso di identificare e datare quattro eventi di entrata del patogeno in Italia.
Gaiarsa S, Comandatore F, Gaibani P, Corbella M, Dalla Valle C, Epis S, Scaltriti E, Carretto E, Farina C, Labonia M, Landini MP, Pongolini S, Sambri V, Bandi C, Marone P, Sassera D. Genomic epidemiology of Klebsiella pneumoniae: the Italian scenario, and novel insights into the origin and global evolution of resistance to carbapenem antibiotics. Antimicrob Agents Chemother. 2014 Nov 3. pii: AAC.04224-14.
LINK: http://aac.asm.org/content/early/2014/10/28/AAC.04224-14.short