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4 Febbraio 2015, il progetto Epidemiologia Genomica pubblica un articolo sulla rivista "Journal of Clinical Microbiology".

Il lavoro riguarda la ricostruzione di un outbreak di un importante patogeno alimentare, Salmonella enterica.  31 genomi del patogeno sono stati ottenuti da campioni di cibo contaminato, campionamenti ambientali presso i siti di produzione e da pazienti infetti. Analisi bioinformatiche hanno permesso di ricostruire la diffusione del batterio, in particolare per quanto riguarda il passaggio all'ospite umano.

Il lavoro ha, inoltre, permesso di perfezionare l'utilizzo delle tecniche di filogenesi in contesti epidemiologici.

Scaltriti E, Sassera D, Comandatore F, Morganti M, Mandalari C, Gaiarsa S, Bandi C, Zehender G, Bolzoni L, Casadei G, Pongolini S. Differential Single Nucleotide Polymorphism-Based Analysis of an Outbreak Caused by Salmonella enterica Serovar Manhattan Reveals Epidemiological Details Missed by Standard Pulsed-Field Gel Electrophoresis. J Clin Microbiol. 2015 Apr;53:1227-38.

LINK: http://jcm.asm.org/content/53/4/1227.abstract